イケダ　マサミ   IKEDA Masami   池田　修己    所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科    職種   助教
言語種別	英語
発行・発表の年月	2009/02
形態種別	学術雑誌
査読	査読あり
標題	"Development of prediction method for GPCR - G-protein coupling selectivity using amino acid properties"
執筆形態	共同
掲載誌名	The Open Structural Biology Journal (Bentham Science Publishers)
巻・号・頁	pp.149-158
著者・共著者	Yukimitsu Yabuki, Masami Ikeda, Yuri Mukai-Ikeda, Yoshihisa Ishida
概要	本論文ではGタンパク質共役受容体（GPCR）配列中の特定位置におけるアミノ酸特性値を用いて、GPCRと結合するGタンパク質種を予測する手法を提案した。Fisher Ratioを用いて特性値を適用し、各残基位置におけるGタンパク質結合種ごとの特性の差異を抽出した。抽出情報を特徴量としてサポートベクターマシンによる学習とテストを繰り返し、精度評価を行った。その結果、97%以上の精度で正しく予測できた。