イケダ　マサミ   IKEDA Masami   池田　修己    所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科    職種   助教
言語種別	英語
発行・発表の年月	2004/02
形態種別	学術雑誌
査読	査読あり
標題	"ConPredelite: a highly reliable approach to transmembrane topology prediction"
執筆形態	共同
掲載誌名	Computational Biology and Chemistry (Elsevier)
巻・号・頁	pp.51-60
著者・共著者	Jun-Xiong Xia, Masami Ikeda, Toshio Shimizu
概要	本論文では、これまでに提案されている5種類の膜貫通トポロジー予測法を用いて、信頼性の高い予測膜貫通トポロジーモデルを獲得するためのコンセンサス予測法ConPredeliteを開発した。このアプローチでは、次の2つの場合にだけ膜貫通トポロジー予測を成立させる：5つの予測法による膜貫通トポロジーモデルが、(i) 全て一致している、(ii) 膜貫通セグメント本数・位置は全て一致しているが、膜貫通方向が2つに割れる。ConPredeliteは、実験により膜貫通トポロジーが決定された原核生物由来138配列の30%、真核93配列の22%を予測することができ、これらの内、それぞれ98%、95%を正しく予測することができることを示した。