イケダ　マサミ   IKEDA Masami   池田　修己    所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科    職種   助教
言語種別	英語
発行・発表の年月	2004/07
形態種別	学術雑誌
査読	査読あり
標題	"ConPred II: a consensus prediction method for obtaining transmembrane topology models with high-reliability"
執筆形態	共同
掲載誌名	Nucleic Acids Research (Oxford University Press)
巻・号・頁	pp.W390-W393
著者・共著者	Masafumi Arai, Hironori Mitsuke, Masami Ikeda, Jun-Xiong Xia, Takashi Kikuchi, Masanobu Satake, Toshio Shimizu
概要	本論文では、既に提案されている膜貫通トポロジー予測法による予測モデルを統合した結果を出力するサーバーであるConPred IIを開発し、インターネット上に公開した (http://bioinfo. si.hirosaki-u.ac.jp/~ConPred2/)。サーバーではアミノ酸配列情報を入力することによって、テキストによる膜貫通トポロジー予測結果を得ることが可能である。さらにJavaアプレットによってハイドロパシー図、ヘリカルホイール図、スネークライク図を出力し、予測膜貫通トポロジーモデルの形や物理化学的性質を視覚的あるいは直感的に理解することを可能にしている。