IKEDA Masami    Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering    Position   Assistant Professor
Language	English
Publication Date	2009/02
Type	Academic Journal
Peer Review	Peer reviewed
Title	"Development of prediction method for GPCR - G-protein coupling selectivity using amino acid properties"
Contribution Type	Collaboration
Journal	The Open Structural Biology Journal (Bentham Science Publishers)
Volume, Issue, Page	pp.149-158
Author and coauthor	Yukimitsu Yabuki, Masami Ikeda, Yuri Mukai-Ikeda, Yoshihisa Ishida
Details	本論文ではGタンパク質共役受容体（GPCR）配列中の特定位置におけるアミノ酸特性値を用いて、GPCRと結合するGタンパク質種を予測する手法を提案した。Fisher Ratioを用いて特性値を適用し、各残基位置におけるGタンパク質結合種ごとの特性の差異を抽出した。抽出情報を特徴量としてサポートベクターマシンによる学習とテストを繰り返し、精度評価を行った。その結果、97%以上の精度で正しく予測できた。