IKEDA Masami
   Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering
   Position   Assistant Professor
Language English
Publication Date 2012/06
Type Academic Journal
Peer Review Peer reviewed
Title "A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network"
Contribution Type Collaboration
Journal Current Bioinformatics (Bentham Science Publishers)
Volume, Issue, Page pp.125-131
Author and coauthor Yuri Mukai, Hirotaka Tanaka, Masao Yoshizawa, Osamu Oura, Takanori Sasaki, Masami Ikeda
Details これまでの論文では、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質においては糖脂質GPIが修飾される残基付近のアミノ酸出現傾向が重要であることを指摘してきた。本論文では、GPIの修飾を受ける残基付近のアミノ酸組成から算出した位置特異的スコアを、機械学習のひとつである逆誤差伝播型人工ニューラルネットワークに適用させることによって、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質を高精度に判別する方法を報告した。