IKEDA Masami
Department Aoyama Gakuin University Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering Position Assistant Professor |
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Language | English |
Publication Date | 2012/06 |
Type | Academic Journal |
Peer Review | Peer reviewed |
Title | "A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network" |
Contribution Type | Collaboration |
Journal | Current Bioinformatics (Bentham Science Publishers) |
Volume, Issue, Page | pp.125-131 |
Author and coauthor | Yuri Mukai, Hirotaka Tanaka, Masao Yoshizawa, Osamu Oura, Takanori Sasaki, Masami Ikeda |
Details | これまでの論文では、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質においては糖脂質GPIが修飾される残基付近のアミノ酸出現傾向が重要であることを指摘してきた。本論文では、GPIの修飾を受ける残基付近のアミノ酸組成から算出した位置特異的スコアを、機械学習のひとつである逆誤差伝播型人工ニューラルネットワークに適用させることによって、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質を高精度に判別する方法を報告した。 |