IKEDA Masami    Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering    Position   Assistant Professor
Language	English
Publication Date	2000/12
Type	Academic Journal
Peer Review	Peer reviewed
Title	"Evaluation of transmembrane topology prediction methods by using an experimentally characterized topology dataset"
Contribution Type	Collaboration
Journal	Genome Informatics (Universal Academy Press)
Volume, Issue, Page	pp.426-427
Author and coauthor	Masami Ikeda, Masafumi Arai, Toshio Shimizu
Details	これまでに提案されている10種類の膜貫通トポロジー予測法の客観的な性能評価を行なった。評価用データセットには文献から収集した実験的根拠に基づく膜貫通トポロジーデータ中の非冗長な原核生物種70、真核生物種52配列を用いた。最も高い膜貫通トポロジー予測精度は原核と真核でそれぞれ64.3%、40.4%であった。このことから、既存予測法の精度は決して高いものではなく、改良の余地があることを明らかにした。