IKEDA Masami    Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering    Position   Assistant Professor
Language	English
Publication Date	2001/12
Type	Academic Journal
Peer Review	Peer reviewed
Title	"Comprehensive analysis of transmembrane protein sequences in 39 microbial genomes"
Contribution Type	Collaboration
Journal	Genome Informatics (Universal Academy Press)
Volume, Issue, Page	pp.338-339
Author and coauthor	Masafumi Arai, Keisuke Noto, Demelo M. Lao, Masami Ikeda, Toshio Shimizu
Details	本論文では、ゲノム配列が明らかになった原核生物39種に対して、①水溶性タンパク質か膜タンパク質かの予測判別、②シグナルペプチド配列領域の予測、③膜貫通タンパク質に対するトポロジー予測の手順を用いて、比較ゲノム解析を行った。解析の結果、ゲノム中の平均約22%の遺伝子が膜タンパク質をコードしており、このうち13%がシグナルペプチドを持つ配列がコードされていることを明らかにした。