IKEDA Masami
   Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering
   Position   Assistant Professor
Language English
Publication Date 2009/06
Type Academic Journal
Peer Review Peer reviewed
Title "Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix"
Contribution Type Collaboration
Journal FEBS Journal (Wiley-Blackwell)
Volume, Issue, Page pp.126-127
Author and coauthor Yuri Mukai, Osamu Oura, Takanori Sasaki, Yukimitsu Yabuki, Masami Ikeda
Details GPIアンカー型タンパク質はヒトの重篤な疾患と関連が深いが、ヒトゲノムには未だ同定されていないGPIアンカー型タンパク質が多数潜んでいることが指摘されている。そこで我々は、哺乳類GPIアンカー型タンパク質のアミノ酸配列の物理化学的特徴の抽出を試みた。その結果、N末端側とC末端側の高疎水性領域と、糖脂質GPIが修飾される残基付近のアミノ酸出現傾向が、GPI修飾に本質的であることが明らかになった。