IKEDA Masami
   Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering
   Position   Assistant Professor
Language English
Publication Date 2003/09
Type 学術雑誌
査読 査読あり
標題 "A highly reliable approach to transmembrane topology prediction"
執筆形態 共同
掲載誌名 Proceedings of the European Conference on Computational Biology 2003
巻・号・頁 pp.177-178
著者・共著者 Masami Ikeda, Jun-Xiong Xia, Toshikatsu Okuno, Toshio Shimizu
概要 本論文では、これまでに提案されている5種類の膜貫通トポロジー予測法を用いて、信頼性の高い予測膜貫通トポロジーモデルを獲得するためのコンセンサス予測法(ConPredelite)を開発した。この方法は、実験により膜貫通トポロジーが決定された原核生物由来138配列の30%、真核93配列の22%を予測することができ、これらの内、それぞれ98%、95%を正しく予測することができることを示した。