IKEDA Masami
   Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering
   Position   Assistant Professor
Language English
Publication Date 2003/09
Type Academic Journal
Peer Review Peer reviewed
Title "A highly reliable approach to transmembrane topology prediction"
Contribution Type Collaboration
Journal Proceedings of the European Conference on Computational Biology 2003
Volume, Issue, Page pp.177-178
Author and coauthor Masami Ikeda, Jun-Xiong Xia, Toshikatsu Okuno, Toshio Shimizu
Details 本論文では、これまでに提案されている5種類の膜貫通トポロジー予測法を用いて、信頼性の高い予測膜貫通トポロジーモデルを獲得するためのコンセンサス予測法(ConPredelite)を開発した。この方法は、実験により膜貫通トポロジーが決定された原核生物由来138配列の30%、真核93配列の22%を予測することができ、これらの内、それぞれ98%、95%を正しく予測することができることを示した。