IKEDA Masami
   Department   Aoyama Gakuin University  Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering
   Position   Assistant Professor
Language English
Publication Date 2010/12
Type Academic Journal
Peer Review Peer reviewed
Title "Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences"
Contribution Type Collaboration
Journal Proceedings of the 2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (IEEE Xplore)
Volume, Issue, Page pp.113-117
Author and coauthor Yuri Mukai, Osamu Oura, Takanori Sasaki, Masami Ikeda
Details GPIアンカー型タンパク質は、癌やアルツハイマー、プリオン病など、ヒトの重篤な疾患と関連が深い。しかしながら、現在同定されているGPIアンカー型タンパク質は半数に満たないといわれている。そこで我々は、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質のアミノ酸配列の物理化学的特徴を抽出し、アミノ酸組成から算出した位置特異的スコアマトリクスからGPIアンカー型タンパク質を高精度に判別する方法論を開発した。