|
IKEDA Masami
Department Aoyama Gakuin University Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering Position Assistant Professor |
|
| Language | English |
| Publication Date | 2003/01 |
| Type | Academic Journal |
| Peer Review | Peer reviewed |
| Title | "Comprehensive analysis of transmembrane topologies in prokaryotic genomes" |
| Contribution Type | Collaboration |
| Journal | Gene (Elsevier) |
| Volume, Issue, Page | pp.77-86 |
| Author and coauthor | Masafumi Arai, Masami Ikeda, Toshio Shimizu |
| Details | 本論文では、(1) SOSUIによる水溶性タンパク質か膜タンパク質かの予測判別、(2) DetecSigによるシグナルペプチド配列領域の予測、(3) ConPredによる膜貫通タンパク質に対するトポロジー予測の手順を用いて、ゲノム配列が明らかになった原核生物50種に対して解析を行った。解析の結果、ゲノム中の平均約22%の遺伝子が膜タンパク質をコードしており、このうち13%がシグナルペプチドを持つことが見積もられた。 |