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IKEDA Masami
Department Aoyama Gakuin University Department of Chemistry and Biological Science, College of Science and Engineering Position Assistant Professor |
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| Language | English |
| Publication Date | 2004/07 |
| Type | Academic Journal |
| Peer Review | Peer reviewed |
| Title | "ConPred II: a consensus prediction method for obtaining transmembrane topology models with high-reliability" |
| Contribution Type | Collaboration |
| Journal | Nucleic Acids Research (Oxford University Press) |
| Volume, Issue, Page | pp.W390-W393 |
| Author and coauthor | Masafumi Arai, Hironori Mitsuke, Masami Ikeda, Jun-Xiong Xia, Takashi Kikuchi, Masanobu Satake, Toshio Shimizu |
| Details | 本論文では、既に提案されている膜貫通トポロジー予測法による予測モデルを統合した結果を出力するサーバーであるConPred IIを開発し、インターネット上に公開した (http://bioinfo.
si.hirosaki-u.ac.jp/~ConPred2/)。サーバーではアミノ酸配列情報を入力することによって、テキストによる膜貫通トポロジー予測結果を得ることが可能である。さらにJavaアプレットによってハイドロパシー図、ヘリカルホイール図、スネークライク図を出力し、予測膜貫通トポロジーモデルの形や物理化学的性質を視覚的あるいは直感的に理解することを可能にしている。 |