青山学院大学教員情報

■ 専門分野及び関連分野

生命・健康・医療情報学, 生物物理学, タンパク質科学, バイオインフォマティクス, バイオデータベース

■ 学歴・学位

1.	青森公立大学経営経済学部経営経済学科卒業
2.	弘前大学大学院理学研究科情報科学専攻修士課程修了
3.	岩手大学大学院連合農学研究科生物資源科学専攻博士課程修了
4.	岩手大学博士(農学)

■ 職歴

1.	2004/05～2005/03	独立行政法人産業技術総合研究所生命情報科学研究センターテクニカルスタッフ
2.	2005/04～2007/03	独立行政法人産業技術総合研究所生命情報科学研究センター産総研特別研究員
3.	2007/04～2009/03	早稲田大学 IT研究機構ITバイオ研究所研究員
4.	2007/04～2009/03	早稲田大学先端科学・健康医療融合研究機構生命医療工学研究所客員講師（専任扱い）
5.	2008/04～2016/03	明治大学理工学部兼任講師
6.	2009/04～2010/03	早稲田大学 IT研究機構ITバイオ研究所客員研究員
7.	2009/04～2010/03	明治大学農学部農芸化学科研究推進員
8.	2010/04～2016/03	神奈川工科大学応用バイオ科学部応用バイオ科学科非常勤講師
9.	2012/09～2013/03	青山学院大学理工学部化学・生命科学科助手
10.	2013/04～2018/03	青山学院大学理工学部化学・生命科学科助教
11.	2024/04～	青山学院大学理工学部化学・生命科学科助教
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■ 所属学会

1.	2000/12～	日本バイオインフォマティクス学会
2.	2001/10～	日本生物物理学会
3.	2003/03～	情報処理学会

■ 賞

1.

2003/05

社団法人情報処理学会平成14年度東北支部奨励賞

■ 研究課題・受託研究・科研費

1.		アミノ酸配列情報によるタンパク質構造クラスの判別予測法の開発個人研究
2.		バイオインフォマティクス技術を用いたタンパク質の構造・機能予測個人研究
3.		膜タンパク質のトポロジー予測法の開発個人研究
4.		膜タンパク質の配列─構造情報帰属データベースの構築個人研究

■ 研究業績（著書・論文等）

1.	論文	A computational method for detecting GPI-anchored proteins and their GPI modification sites by neural networks Proceedings of the 11th European Conference on Computational Biology (ECCB2012) 121頁（共著） 2012/09
2.	論文	"A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network" Current Bioinformatics (Bentham Science Publishers) pp.125-131 （共著） 2012/06
3.	論文	"Discrimination of Golgi type II membrane proteins based on their hydropathy profiles and the amino acid propensities of their transmembrane regions" Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry (Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry) pp.82-88 （共著） 2011/01
4.	論文	"A discrimination method for Golgi type II membrane proteins based on the hydropathy alignment and the position-specific score matrix around their transmembrane regions" Proceedings of the 2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (IEEE Xplore) pp.82-87 （共著） 2010/12
5.	論文	"Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences" Proceedings of the 2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (IEEE Xplore) pp.113-117 （共著） 2010/12
6.	論文	"Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix" FEBS Journal (Wiley-Blackwell) pp.126-127 （共著） 2009/06
7.	論文	"Development of prediction method for GPCR - G-protein coupling selectivity using amino acid properties" The Open Structural Biology Journal (Bentham Science Publishers) pp.149-158 （共著） 2009/02
8.	論文	"ConPred II: a consensus prediction method for obtaining transmembrane topology models with high-reliability" Nucleic Acids Research (Oxford University Press) pp.W390-W393 （共著） 2004/07
9.	論文	"ConPred_elite: a highly reliable approach to transmembrane topology prediction" Computational Biology and Chemistry (Elsevier) pp.51-60 （共著） 2004/02
10.	論文	"Proteome-wide classification and identification of mammalian-type GPCRs by binary topology pattern" Computational Biology and Chemistry (Elsevier) pp.39-49 （共著） 2004/02
11.	論文	"Genomic analysis of immunity in a Urochordate and the emergence of the vertebrate immune system: "waiting for Godot"" Immunogenetics (SpringerLink) pp.570-581 （共著） 2003/11
12.	論文	"A highly reliable approach to transmembrane topology prediction" Proceedings of the European Conference on Computational Biology 2003 pp.177-178 （共著） 2003/09
13.	論文	"Comprehensive analysis of transmembrane topologies in prokaryotic genomes" Gene (Elsevier) pp.77-86 （共著） 2003/01
14.	論文	"TMPDB: a database of experimentally-characterized transmembrane topologies" Nucleic Acids Research (Oxford University Press) pp.406-409 （共著） 2003/01
15.	論文	"Identification and classification of eukaryotic GPCRs by binary topology pattern" Genome Informatics (Universal Academy Press) pp.334-335 （共著） 2002/12
16.	論文	"The presence of signal peptide significantly affects transmembrane topology prediction" Bioinformatics (Oxford University Press) pp.562-566 （共著） 2002/12
17.	論文	"Transmembrane topology prediction methods: a re-assessment and improvement by a consensus method using a dataset of experimentally-characterized transmembrane topologies" In Silico Biology (IOS Press) pp.19-33 （共著） 2002/01
18.	論文	"Classification of eukaryotic 7-tms transmembrane proteins by binary topology pattern" Genome Informatics (Universal Academy Press) pp.336-337 （共著） 2001/12
19.	論文	"Comprehensive analysis of transmembrane protein sequences in 39 microbial genomes" Genome Informatics (Universal Academy Press) pp.338-339 （共著） 2001/12
20.	論文	"Genome-scale analysis of prokaryotic transmembrane proteins by a consensus prediction method" Proceedings of the 4th International Conference on Biological Physics 60頁（共著） 2001/07
21.	論文	"The prediction accuracy of transmembrane topology is improved by a consensus method: An application to genome-wide analysis" Proceedings of the 4th International Conference on Biological Physics pp.60 （共著） 2001/07
22.	論文	"Structure design of neural networks using genetic algorithm" Complex Systems (Complex Systems Publications) pp.161-175 （共著） 2001/03
23.	論文	"Evaluation of transmembrane topology prediction methods by using an experimentally characterized topology dataset" Genome Informatics (Universal Academy Press) pp.426-427 （共著） 2000/12
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■ 研究業績（招待講演）

1.	2012/09/19	Computational detection of organelle sorting signals in membrane localized proteins（Sendai）
2.	2005/03/05	『膜タンパク質ドメインデータベースの構築に向けて』（かずさアカデミアホール, 木更津）

■ 研究業績（学会発表）

1.	2012/09/09	A computational method for detecting GPI-anchored proteins and their GPI modification sites by neural networks（11th European Conference on Computational Biology (ECCB2012)）
2.	2010/12/06	"Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences"（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (TISC2010)）
3.	2010/12/06	A discrimination method for golgi type II membrane proteins based on the hydropathy alignment and the position-specific score matrix around their transmembrane regions（2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (TISC2010)）
4.	2009/07/04	"Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix"（34th FEBS Congress）
5.	2009/03/17	『サポートベクターマシンを用いたGPCR-Gタンパク質結合選択性予測法の開発』（電子情報通信学会 2009年総合大会）
6.	2004/02/27	『ConPred_elite: 高信頼性の膜貫通トポロジー予測』（情報処理学会東北支部平成15年度第4回研究会）
7.	2003/09/27	"A highly reliable approach to transmembrane topology prediction"（European Conference on Computational Biology (ECCB2003)）
8.	2003/09/23	『高信頼性膜貫通トポロジー予測データを得るための一つのアプローチ』（日本生物物理学会第41回年会）
9.	2003/01/09	『ConPred: コンセンサス膜貫通トポロジー予測システム』（文部科学省特定領域研究「ゲノム情報科学」公開シンポジウム）
10.	2003/01/09	『TMPDB: 膜貫通トポロジーデータベース』（文部科学省特定領域研究「ゲノム情報科学」公開シンポジウム）
11.	2002/12/16	"Identification and classification of eukaryotic GPCRs by binary topology pattern"（13th International Conference on Genome Informatics (GIW2002)）
12.	2002/11/02	『Binary Topology Pattern による真核ゲノムGPCRの機能分類・同定』（日本生物物理学会第40回年会）
13.	2002/11/02	『予測法と実験の組合せによる網羅的膜貫通トポロジー決定』（日本生物物理学会第40回年会）
14.	2002/11/02	『膜貫通タンパク質におけるN端ループの機能 ─ タイプIとタイプIIIでの使い分けはあるのか? ─』（日本生物物理学会第40回年会）
15.	2002/02/21	『膜貫通トポロジーデータベースの構築及びコンセンサス膜貫通トポロジー予測システム』（情報処理学会東北支部研究会平成14年度第4回研究会）
16.	2002/01/11	『膜貫通トポロジーデータベース及びコンセンサス膜貫通トポロジー予測システム：TMPDB & ConPred』（文部科学省科学研究費特定領域研究C 「ゲノム情報科学」『ゲノム情報科学の新展開 (GenProC2002)』公開シンポジウム）
17.	2001/12/17	"Classification of eukaryotic 7-tms transmembrane proteins by binary topology pattern"（12th International Conference on Genome Informatics (GIW2001)）
18.	2001/12/17	Comprehensive analysis of transmembrane protein sequences in 39 microbial genomes（12th International Conference on Genome Informatics (GIW2001)）
19.	2001/11/16	『膜貫通トポロジー予測法の性能評価とコンセンサス法による予測精度の向上』（人工知能学会第2種研究会分子生物情報研究会 (SIGMBI) 第18回研究会）
20.	2001/10/06	『膜貫通タンパク質におけるシグナルペプチド ─ ゲノムスケール解析から見えてきたこと ─』（日本生物物理学会第39回年会）
21.	2001/07/30	"The prediction accuracy of transmembrane topology is improved by a consensus method: An application to genome-wide analysis"（4th International Conference on Biological Physics (ICBP2001)）
22.	2001/07/30	Genome-scale analysis of prokaryotic transmembrane proteins by a consensus prediction method（4th International Conference on Biological Physics (ICBP2001)）
23.	2001/02/22	『実験情報つき膜貫通トポロジーデータを用いたトポロジー予測法の性能評価 ─ 統合化による予測性能の大幅向上を目指して ─』（情報処理学会東北支部研究会平成12年度第3回研究会）
24.	2001/01/22	『統合化方式による膜貫通トポロジー予測の精度向上』（文部省科学研究費特定領域研究C「ゲノム情報科学の新展開」- 第１回「タンパク質高次構造に基づくゲノム情報科学」公開ワークショップ）
25.	2000/12/18	"Evaluation of transmembrane topology prediction methods by using an experimentally characterized topology dataset"（11th International Conference on Genome Informatics (GIW2000)）
26.	2000/09/11	『組み込みメカニズムに基づく膜貫通トポロジー予測』（日本生物物理学会第38回年会）
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■ 研究業績（取得特許）

1.	2010/07/29	『立体構造データ帰属方法、立体構造データ帰属プログラム及び立体構造データ帰属装置』（共同）（2010-165216）
2.	2010/10/22	『GPIアンカー型タンパク質の判別装置、判別方法及びプログラム』（共同）（4608698）
3.	2012/02/16	『GPIアンカー型タンパク質の判定装置、判定方法及び判定プログラム』（共同）（2012-32163）